1、内蒙古大学（世界一流学科建设高校）

创建于1957年，1962年开始招收研究生，1978年确定为全国重点大学，1997年成为“211工程”重点建设大学。

2、内蒙古工业大学

前身为创建于1951年的绥远省高级工业学校，1958年在清华大学等支援下成立内蒙古工学院，1993年更名为内蒙古工业大学。

3、内蒙古农业大学

前身为1952年原河北农学院、平原农学院畜牧兽医系、山西农学院兽医专业迁至归绥（今呼和浩特），组建内蒙古畜牧兽医学院，1960年改为内蒙古农牧学院，1999年与内蒙古林学院（1958年成立）合并组建内蒙古农业大学。

4、内蒙古师范大学

前身为创办于1952年的内蒙古师范学院，1954年内蒙古师范专科学院并入，学院由乌兰浩特市迁至呼和浩特市，1982年更名为内蒙古师范大学。

5、内蒙古医科大学

前身为创办于1956年的内蒙古医学院，2012年更名为内蒙古医科大学。

6、内蒙古财经大学

前身为始建于1960年的内蒙古财经学院，1962年改为内蒙古财贸干部进修学院，1965年改为内蒙古财贸学校，2012年更名为内蒙古财经大学。